При чем тут внутри? Когда ботинок стоит "вверх головой", то пары могут беспрепятственно подниматься вверх, за пределы ботинка. Естественно, что на его место приходит сухой(ну или какой есть)

Для хорошей сушки должен быть отток паров воды, плюс условия для образования паров. Первое достигается положением бота. Второе - можно разными методами (в теории) но на практике самое эффективное - это приток сухого воздуха.

На боку можно сушить ботинки, которые, лежа на этом боку, не имеют локальных экстремумов, из которых пары не выходят наружу.