Опробовал виртуалдуб на большом наборе файлов. Все нуочень продуктивно, даже самым тупым способом - загружаешь ВСЕ файлы в проект, будь их хоть 10 гиг. Ищешь нужные куски, остальное "под нож". Все виртуально, но тут же можно поглядеть результат, и если надо, отменить. Поскольку просмотр наглядный, записывать секунды на бумажку не нужно. Можно переставить куски с места на место, скопировать, ну и так далее - все интуитивно ясно. Минут 15, и мини-клип готов и можно в ютуб. Примерно такой:
http://www.youtube.com/watch?v=CZI3to52KLo
Если есть желание быстро загрузить, то есть смысл сначала сжать в Xvid-avi. Если нет, то можно и несжатый поставить на закачку, ютуб сожмет сам. Но будет долго.